Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMOD2Q9NZR1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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