Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms