Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms