Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB4Q9NTQ9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms