Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL1Q9NSC2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms