Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPOLBQ9NRJ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms