Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BATF3Q9NR55 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms