Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms