Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHARPINQ9H0F6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms