Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms