Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK3Q96PN8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms