Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms