Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUB1Q96FW1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUB1Q96FW1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms