Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms