Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms