Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUAP1Q96AJ1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUAP1Q96AJ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms