Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRUQ92729 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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