Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY2Q8WXA3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms