Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00301Q8NCQ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms