Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCF23Q7RTU1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCF23Q7RTU1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms