Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms