Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PREX2Q70Z35 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms