Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZCCHC12Q6PEW1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms