Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNS3Q68CZ2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNS3Q68CZ2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms