Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PXDC1Q5TGL8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms