Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms