Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAN3Q58A45 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAN3Q58A45 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms