Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL22Q53GT1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms