Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKDCCQ504Y2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms