Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC38Q502W7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms