Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDNFQ49AH0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms