Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms