Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP20-1Q3LI63 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms