Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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