Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms