Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A3Q16572 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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