Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNCBQ16143 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms