Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USF2Q15853 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms