Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms