Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF13Q15543 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF13Q15543 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms