Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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