Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms