Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4Q12950 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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