Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF2Q12947 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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