Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ILF3Q12906 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.528e-12■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 C5orf15-202ENST00000507191 635 ntTSL 211.72□□□□□ -0.538e-12■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 411.67□□□□□ -0.546e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.676e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 COQ4-203ENST00000461102 3127 ntTSL 210.44□□□□□ -0.747e-6■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 PVT1-207ENST00000518528 624 ntTSL 38.96□□□□□ -0.986e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.982e-6■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 KANSL1-234ENST00000640636 605 ntTSL 55.8□□□□□ -1.482e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 PVT1-205ENST00000517790 599 ntTSL 24.81□□□□□ -1.646e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 MATR3-226ENST00000515833 1001 ntTSL 53.37□□□□□ -1.872e-8■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-9■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-9■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 GABPB1-212ENST00000615671 6266 nt18.59■□□□□ 0.573e-9■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -01e-9■■■□□ 15.7
ILF3Q12906 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-9■■■□□ 15.7
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