Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBRQ0VD83 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBRQ0VD83 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms