Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCK1Q08629 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms