Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms