Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms