Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms